Михаил Борисович Пиотровский – член-корреспондент Российской Академии наук, член президиума РАН, действительный член Российской Академии художеств, член Совета при Президенте Российской Федерации по культуре и искусству, по науке и образованию; профессор Санкт-Петербургского Государственного Университета, где он заведует кафедрами «Музейное дело и охрана памятников» и «Древний Восток», декан Восточного факультета; иностранный член Академии наук Армении, член Академии наук Татарстана, почетный доктор Казанского государственного университета, почетный доктор Саратовского государственного университета имени Н.Г. Чернышевского и Саратовского социально-экономического университета, президент Союза музеев России, президент Всемирного клуба петербуржцев, председатель Попечительского совета Европейского университета в Санкт-Петербурге, член-корреспондент Германского археологического института, главный редактор журнала «Христианский Восток», председатель петербургского отделения Российского православного палестинского общества, президент регионального общественного движения «Конгресс петербургской интеллигенции», сопредседатель Совета по популяризации и поддержке российского культурного наследия Россотрудничества. Михаил Борисович входит в состав Консультативной группы Совета Европы по выставочной деятельности.

Михаил Борисович Пиотровский награжден орденом Королевского дома Оранских-Нассау (Нидерланды, 1996), орденом Почета (Россия, 1997), орденом Почетного Легиона (Франция, 1998, 2004), орденом Полярной Звезды (Швеция, 1999), орденом «За заслуги перед Итальянской Республикой» (Италия, 2000, 2004), орденом Святого Месропа (Армянская апостольская церковь, 2000), орденом Ярослава Мудрого (Украина, 2003), орденом «За заслуги» (Польша, 2004), орденом «За заслуги перед Отечеством» (Россия, 2004, 2009), орденом «Аль-Фахр» (Совет Муфтиев России, 2005), орденом Льва Финляндии (Финляндия, 2005), орденом Восходящего солнца, Золотая и Серебряная звезда (Япония, 2007), Серебряной медалью Амстердама (2009), наградой Международного научного центра Вудро Вильсона, (США, 2009), Орденом Короны (Бельгия, 2011), наградой Министерства юстиции России - Медалью Анатолия Кони (2013). В 2003 году Михаил Борисович Пиотровский награжден Президентской премией в области литературы и искусства. Лауреат общественной премии «Небесная линия».

В 1997 году в честь отца и сына - Бориса Борисовича и Михаила Борисовича Пиотровских - Международный Астрономический Союз присвоил одной из открытых малых планет имя «Пиотровский».

25 мая 2011 года Михаилу Борисовичу Пиотровскому присвоено звание Почетного гражданина Санкт-Петербурга.